物流出入库、线上库存、订单管理以及门店订单物流管理平台系统的软件开发，其关键模块主要包括以下几个方面：

系统设置模块主要用于客户、商品信息、远程仓库、数据库备份、历史业务数据处理、系统用户权限设置等主要系统参数的初始设置或维护。这是整个物流管理系统的基础，确保系统的正常运行和数据的准确性。

订单管理模块是物流管理系统的核心部分，主要处理客户订单，确保订单及时、准确地执行。它包括以下功能：

订单接收与处理：快速接收订单，并通过自动化流程进行处理，提高效率。

订单追踪：实时追踪订单状态，确保订单从接收到发货的全过程透明可控。

订单分析：通过数据分析，了解订单的来源、类型、数量等，为企业决策提供数据支持。

库存管理模块提供进出库、货物或材料的进出、库存盘点、库存预警、库存详细查询、图形统计等功能分析。通过该模块，企业可以实时掌握库存数量、库存成本以及商品的存储位置，有助于库存的jingque控制，提高仓库的运作效率，减少库存积压和浪费。

出入库管理模块确保商品准确、及时地出入库，主要功能包括：

创建和管理出入库单，记录每次出入库的详细信息。

支持手动录入和自动生成出入库单。

指导仓库人员按订单拣货或上架，确保拣货或上架准确。

记录拣货或上架过程，提供拣货或上架效率分析。

运输管理模块涉及商品从仓库到客户手中的全过程，包括选择合适的运输方式、安排运输计划以及跟踪运输状态。它主要包括以下功能：

运输路线优化：通过数据分析，优化运输路线，节省运输成本。

车辆管理：实时监控车辆状态，合理安排车辆使用，提高车辆利用率。

运输追踪：实时追踪运输过程中的货物，确保运输安全和准时交付。

财务管理模块是企业管理的基础，主要包括以下功能：

费用管理：高效管理各项费用，控制成本。

账务处理：自动化账务处理，提高财务管理的准确性和效率。

财务报表：生成各类财务报表，为企业决策提供数据支持。

客户关系管理模块主要包括以下功能：

客户信息管理：全面管理客户信息，提升客户服务质量。

客户跟进与维护：跟进客户需求，提供个性化服务，提升客户满意度。

客户数据分析：分析客户数据，了解客户需求，为企业营销决策提供数据支持。

数据整合与分析模块整合各个环节的数据，如订单数据、库存数据、运输数据等，形成全面的物流信息视图。同时，对物流过程中的各项数据进行收集和分析，如运输效率、成本统计、客户满意度等，并根据分析结果生成各种报表，为管理层提供决策支持。

安全与权限管理模块确保系统的安全性和数据的保密性。它设置严格的用户权限划分，防止未经授权的数据访问和操作。同时，对用户敏感信息和交易数据进行加密存储和传输，确保数据的安全性。此外，定期对系统数据进行备份，以防数据丢失或损坏。

综上所述，物流出入库、线上库存、订单管理以及门店订单物流管理平台系统的软件开发需要包含以上关键模块，以确保系统的全面性、实用性和安全性。