针对烟酒批发线上分销新零售多门店自助下单的原生APP开发，以下是一些核心的功能模块建议：

用户注册与登录：支持手机号、邮箱等多种方式注册与登录，同时提供第三方社交账号快捷登录选项。

个人信息管理：允许用户编辑个人资料，包括姓名、联系方式、收货地址等，并查看自己的购买历史、积分、优惠券等信息。

会员等级制度：根据用户的消费金额、购买次数、累计积分等多维度行为数据进行等级划分，不同等级享有不同的权益，如更高的积分比例、专属优惠等。

商品展示：提供高清图片、细致描述、价格、库存量、用户评价等商品信息，支持按价格、销量、评价等多种排序方式。

商品分类：根据烟酒产品的种类、品牌、产地等进行详细分类，方便用户快速找到所需商品。

特色产品推荐：基于用户的浏览和购买历史，智能推荐相关商品，提高购买转化率。

自助下单：用户可以在APP上直接选择商品、数量、配送地址等信息，完成订单提交。

订单跟踪：提供订单状态实时更新功能，用户可以随时查看订单的发货、物流、签收等信息。

订单历史：记录用户的所有购买记录，方便用户随时查看和复购。

多种支付方式：支持微信支付、支付宝、银行卡等多种支付方式，确保支付安全、快捷、稳定。

优惠券与积分抵扣：允许用户在支付时使用优惠券或积分进行抵扣，提高用户购买意愿。

一级分销：直接面向用户推销产品，每成功售出一单，分销员能够获取一定比例的佣金。

二级分销：一级分销员发展出下级分销员（即二级分销员），当二级分销员成功销售后，一级分销员同样能获得一定比例的佣金。

分销员管理：提供分销员注册、审核、培训、业绩查看等功能，确保分销体系的健康运行。

库存监控：实时监控各门店的库存情况，确保商品信息的准确性和交易的顺利进行。

智能补货：根据销售数据和市场需求预测，自动触发补货请求，避免缺货或库存积压。

用户行为分析：收集用户在APP上的行为数据，如浏览记录、购买行为、搜索关键词等，进行深度分析。

销售数据分析：统计各商品、各门店的销售数据，为优化营销策略提供数据支撑。

在线客服：提供实时在线客服功能，解答用户关于商品、订单、支付等方面的问题。

售后服务：支持退换货申请、投诉与建议反馈等功能，确保用户满意度。

社交分享：支持用户将商品页面、促销信息等分享到微信、微博等社交平台，扩大商品曝光度。

LBS定位：根据用户位置推荐附近的门店或促销活动，提高用户参与度。

消息推送：向用户推送订单状态更新、促销活动等信息，增强用户粘性。

综上所述，烟酒批发线上分销新零售多门店自助下单的原生APP开发需要综合考虑用户管理、商品管理、订单管理、支付管理、分销管理、库存管理、数据分析、客户服务以及其他功能模块等多个方面，以确保APP的实用性和用户体验。